Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFAF1Q9Y375 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDUFAF1Q9Y375 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFAF1Q9Y375 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms