Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRG3Q9Y2Y8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRG3Q9Y2Y8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms