Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED16Q9Y2X0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED16Q9Y2X0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED16Q9Y2X0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms