Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL20Q9Y2M5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL20Q9Y2M5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL20Q9Y2M5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms