Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIK3Q9Y2K2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms