Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L3Q9Y2J2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41L3Q9Y2J2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms