Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NCKAP1Q9Y2A7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP1Q9Y2A7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP1Q9Y2A7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP1Q9Y2A7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms