Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3LQ9Y262 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3LQ9Y262 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF3LQ9Y262 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3LQ9Y262 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms