Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA2Q9UQC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCA2Q9UQC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA2Q9UQC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA2Q9UQC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms