Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPG7Q9UQ90 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SPG7Q9UQ90 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SPG7Q9UQ90 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPG7Q9UQ90 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPG7Q9UQ90 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
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