Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP24Q9UPU5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP24Q9UPU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP24Q9UPU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms