Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGAP1Q9UPQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGAP1Q9UPQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGAP1Q9UPQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGAP1Q9UPQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGAP1Q9UPQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGAP1Q9UPQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms