Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LHX6Q9UPM6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX6Q9UPM6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHX6Q9UPM6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX6Q9UPM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms