Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC12A4Q9UP95 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC12A4Q9UP95 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A4Q9UP95 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms