Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX7Q9UNH6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX7Q9UNH6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX7Q9UNH6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX7Q9UNH6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms