Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF19Q9UMS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF19Q9UMS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF19Q9UMS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms