Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TTC7AQ9ULT0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC7AQ9ULT0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTC7AQ9ULT0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTC7AQ9ULT0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms