Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MED23Q9ULK4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
MED23Q9ULK4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MED23Q9ULK4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
MED23Q9ULK4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MED23Q9ULK4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms