Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI0

ATAD2B, ATPase family AAA domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2BQ9ULI0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ATAD2BQ9ULI0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ATAD2BQ9ULI0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
ATAD2BQ9ULI0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
ATAD2BQ9ULI0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ATAD2BQ9ULI0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
ATAD2BQ9ULI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
ATAD2BQ9ULI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ATAD2BQ9ULI0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ATAD2BQ9ULI0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ATAD2BQ9ULI0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ATAD2BQ9ULI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ATAD2BQ9ULI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms