Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SARDHQ9UL12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SARDHQ9UL12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SARDHQ9UL12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms