Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AMFRQ9UKV5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AMFRQ9UKV5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AMFRQ9UKV5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AMFRQ9UKV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms