Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PACSIN3Q9UKS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3Q9UKS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3Q9UKS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms