Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC2Q9UKJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHIC2Q9UKJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHIC2Q9UKJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CHIC2Q9UKJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms