Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF223Q9UK11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF223Q9UK11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF223Q9UK11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms