Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT3LQ9UJW3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3LQ9UJW3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3LQ9UJW3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms