Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIMS3Q9UJD0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMS3Q9UJD0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMS3Q9UJD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms