Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH22Q9UJ99 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH22Q9UJ99 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH22Q9UJ99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms