Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMTOR3Q9UHA4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms