Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBEC3BQ9UH17 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3BQ9UH17 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3BQ9UH17 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262 ms