Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APEX2Q9UBZ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APEX2Q9UBZ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APEX2Q9UBZ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms