Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE7Q9UBL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CPNE7Q9UBL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE7Q9UBL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms