Protein–RNA interactions for Protein: Q9P287

BCCIP, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCCIPQ9P287 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 36.78□□□□□ -1.322e-9■■□□□ 12.2
BCCIPQ9P287 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 12.1
BCCIPQ9P287 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 12.1
BCCIPQ9P287 IGF1R-204ENST00000558355 572 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 12.1
BCCIPQ9P287 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 12.1
BCCIPQ9P287 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.33■□□□□ 0.686e-9■■□□□ 12
BCCIPQ9P287 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.516e-9■■□□□ 12
BCCIPQ9P287 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.115e-7■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 215.86■□□□□ 0.135e-7■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.08■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 02e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 EIF4G3-213ENST00000634778 1343 ntTSL 214.6□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 11.9
BCCIPQ9P287 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-33■■□□□ 11.8
BCCIPQ9P287 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC10.9□□□□□ -0.661e-33■■□□□ 11.8
BCCIPQ9P287 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 54.06□□□□□ -1.761e-33■■□□□ 11.8
BCCIPQ9P287 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-37■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt16.32■□□□□ 0.24e-37■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.584e-37■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 522.87■■□□□ 1.252e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.022e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.712e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.682e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.672e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.112e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 59.85□□□□□ -0.832e-43■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.561e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 511.31□□□□□ -0.61e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.631e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.52□□□□□ -0.721e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 49.38□□□□□ -0.911e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 58.52□□□□□ -1.051e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.57□□□□□ -1.361e-21■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 B3GNTL1-205ENST00000571394 774 ntTSL 316.48■□□□□ 0.233e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 B3GNTL1-208ENST00000572977 2446 ntTSL 214.96□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 B3GNTL1-209ENST00000573363 471 ntTSL 214.04□□□□□ -0.163e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 B3GNTL1-202ENST00000570947 390 ntTSL 311.61□□□□□ -0.553e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt8.52□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 11.6
BCCIPQ9P287 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.619e-9■■□□□ 11.4
BCCIPQ9P287 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.089e-9■■□□□ 11.4
BCCIPQ9P287 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.089e-9■■□□□ 11.4
BCCIPQ9P287 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 515.43■□□□□ 0.069e-9■■□□□ 11.4
BCCIPQ9P287 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 26.72□□□□□ -1.339e-9■■□□□ 11.4
BCCIPQ9P287 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-7■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 BCL6-205ENST00000438077 709 ntTSL 321.52■■□□□ 1.042e-7■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-215ENST00000450501 559 ntTSL 419.29■□□□□ 0.684e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-211ENST00000432387 584 ntTSL 419.21■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.484e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 217.57■□□□□ 0.44e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-208ENST00000412591 571 ntTSL 416.8■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-202ENST00000357490 563 ntTSL 416.35■□□□□ 0.214e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.074e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.064e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.024e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.034e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.084e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 ZCCHC14-204ENST00000568020 6242 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.114e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 512.91□□□□□ -0.344e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 BCL6-203ENST00000419510 4178 ntTSL 211.78□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-212ENST00000436564 474 ntTSL 311.68□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-214ENST00000449784 978 ntTSL 39.47□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-218ENST00000466901 598 ntTSL 38.1□□□□□ -1.114e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-216ENST00000452375 600 ntTSL 46.94□□□□□ -1.34e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.394e-6■□□□□ 11.3
BCCIPQ9P287 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-8■□□□□ 11.2
BCCIPQ9P287 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 514.44□□□□□ -0.11e-8■□□□□ 11.2
BCCIPQ9P287 ZIM2-203ENST00000595671 2054 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.245e-22■□□□□ 11
BCCIPQ9P287 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.585e-22■□□□□ 11
BCCIPQ9P287 ZIM2-205ENST00000597281 2037 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.695e-22■□□□□ 11
BCCIPQ9P287 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 229.04■■■□□ 2.248e-6■□□□□ 10.9
BCCIPQ9P287 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 28e-6■□□□□ 10.9
BCCIPQ9P287 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.548e-6■□□□□ 10.9
BCCIPQ9P287 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.148e-6■□□□□ 10.9
BCCIPQ9P287 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 320.31■□□□□ 0.848e-6■□□□□ 10.9
BCCIPQ9P287 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.698e-6■□□□□ 10.9
BCCIPQ9P287 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 519.3■□□□□ 0.688e-6■□□□□ 10.9
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