Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABRACLQ9P1F3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRACLQ9P1F3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRACLQ9P1F3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms