Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N5

TMEM216, Transmembrane protein 216, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM216Q9P0N5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM216Q9P0N5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM216Q9P0N5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM216Q9P0N5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM216Q9P0N5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM216Q9P0N5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms