Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HACD3Q9P035 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACD3Q9P035 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACD3Q9P035 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HACD3Q9P035 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms