Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX1Q9NZR4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX1Q9NZR4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX1Q9NZR4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VSX1Q9NZR4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VSX1Q9NZR4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSX1Q9NZR4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms