Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP39A1Q9NYL5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP39A1Q9NYL5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP39A1Q9NYL5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms