Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DLL3Q9NYJ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DLL3Q9NYJ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DLL3Q9NYJ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DLL3Q9NYJ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms