Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VNN3Q9NY84 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VNN3Q9NY84 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VNN3Q9NY84 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms