Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB20Q9NX57 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB20Q9NX57 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB20Q9NX57 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB20Q9NX57 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB20Q9NX57 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms