Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRNAU1APQ9NX07 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNAU1APQ9NX07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNAU1APQ9NX07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNAU1APQ9NX07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms