Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PANK4Q9NVE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PANK4Q9NVE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PANK4Q9NVE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PANK4Q9NVE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PANK4Q9NVE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANK4Q9NVE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PANK4Q9NVE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PANK4Q9NVE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PANK4Q9NVE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms