Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SETD4Q9NVD3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SETD4Q9NVD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD4Q9NVD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms