Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF19AQ9NV58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF19AQ9NV58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF19AQ9NV58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF19AQ9NV58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF19AQ9NV58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms