Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP5S1Q9NUS5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP5S1Q9NUS5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP5S1Q9NUS5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms