Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEPPQ9NTK1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DEPPQ9NTK1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEPPQ9NTK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms