Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C19orf12Q9NSK7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C19orf12Q9NSK7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C19orf12Q9NSK7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms