Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3GQ9NS98 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3GQ9NS98 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3GQ9NS98 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms