Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CD163L1Q9NR16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CD163L1Q9NR16 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CD163L1Q9NR16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CD163L1Q9NR16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms