Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM5Q9NQX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRDM5Q9NQX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM5Q9NQX1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM5Q9NQX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM5Q9NQX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM5Q9NQX1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms